Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LONRF3Q496Y0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms