Protein–RNA interactions for Protein: Q3SX64

ODF3L2, Outer dense fiber protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3L2Q3SX64 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF3L2Q3SX64 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ODF3L2Q3SX64 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms