Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCGF3Q3KNV8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCGF3Q3KNV8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms