Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC27Q2M243 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC27Q2M243 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms