Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ECM1Q16610 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM1Q16610 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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