Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKN1Q16512 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PKN1Q16512 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
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