Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIK5Q16478 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK5Q16478 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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