Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAMA4Q16363 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
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