Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDK1Q15118 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDK1Q15118 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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