Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM25Q14258 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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