Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
RUNX3Q13761 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNX3Q13761 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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