Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXD4Q12950 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXD4Q12950 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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