Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCB1Q12824 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCB1Q12824 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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