Protein–RNA interactions for Protein: Q12151

UPC2, Sterol uptake control protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPC2Q12151 YDR250CYDR250C 276 nt3.33□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 YER107W-AYER107W-A 321 nt3.33□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 LSM8YJR022W 330 nt3.33□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 SHH3YMR118C 591 nt3.33□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 MSR1YHR091C 1932 nt3.32□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 VBA4YDR119W 2307 nt3.32□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 PWP2YCR057C 2772 nt3.32□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.32□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.32□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 VHR2YER064C 1518 nt3.32□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 CCT7YJL111W 1653 nt3.32□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 VTC4YJL012C 2166 nt3.32□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 LRG1YDL240W 3054 nt3.32□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 URB2YJR041C 3525 nt3.31□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 YFR056CYFR056C 369 nt3.31□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 YGR265WYGR265W 411 nt3.31□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 PAU14YIL176C 363 nt3.31□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 PAU1YJL223C 363 nt3.31□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 RPL9BYNL067W 576 nt3.31□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 ISU1YPL135W 498 nt3.31□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 YPL229WYPL229W 621 nt3.31□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.31□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 YPR022CYPR022C 3402 nt3.31□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 PKH1YDR490C 2301 nt3.31□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.31□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 ZDS2YML109W 2829 nt3.3□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 TSA2YDR453C 591 nt3.3□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 YFL063WYFL063W 456 nt3.3□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt3.3□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 RPB9YGL070C 369 nt3.3□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 GOT1YMR292W 417 nt3.3□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 NMA111YNL123W 2994 nt3.3□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 HFM1YGL251C 3564 nt3.3□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 TRZ1YKR079C 2517 nt3.3□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 ARO1YDR127W 4767 nt3.29□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 GYL1YMR192W 2163 nt3.29□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 DAN4YJR151C 3486 nt3.29□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 LYS9YNR050C 1341 nt3.29□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 CYC7YEL039C 342 nt3.29□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 RPL30YGL030W 318 nt3.29□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 BLI1YKL061W 342 nt3.29□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 YLR294CYLR294C 330 nt3.29□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 YBL073WYBL073W 312 nt3.29□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 CHS3YBR023C 3498 nt3.29□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 YCG1YDR325W 3108 nt3.28□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 ETP1YHL010C 1758 nt3.28□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 OSH6YKR003W 1347 nt3.28□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt3.28□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt3.28□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt3.28□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 snR51snR51 107 nt3.28□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 REG1YDR028C 3045 nt3.28□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 PCF11YDR228C 1881 nt3.28□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 SPA2YLL021W 4401 nt3.28□□□□□ -1.88
UPC2Q12151 COX1Q0045 1605 nt3.27□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 PDC2YDR081C 2778 nt3.27□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 RPS23AYGR118W 438 nt3.27□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 TIM8YJR135W-A 264 nt3.27□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 MRP8YKL142W 660 nt3.27□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 RPS22BYLR367W 393 nt3.27□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 RPS23BYPR132W 438 nt3.27□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt3.27□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 RPN2YIL075C 2838 nt3.27□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 STN1YDR082W 1485 nt3.27□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 ATG26YLR189C 3597 nt3.27□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 YLR352WYLR352W 2424 nt3.27□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 SPP382YLR424W 2127 nt3.26□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 MSH2YOL090W 2895 nt3.26□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 RAD5YLR032W 3510 nt3.26□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 YTA7YGR270W 4140 nt3.26□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 NSP1YJL041W 2472 nt3.26□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 MTR4YJL050W 3222 nt3.26□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 MNT3YIL014W 1893 nt3.26□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 URA2YJL130C 6645 nt3.26□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 HEF3YNL014W 3135 nt3.26□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 SSY1YDR160W 2559 nt3.25□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 RSF2YJR127C 4143 nt3.25□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 SMC3YJL074C 3693 nt3.25□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 HYR1YIR037W 492 nt3.25□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 ANB1YJR047C 474 nt3.25□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt3.25□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 YPR099CYPR099C 357 nt3.25□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 SET1YHR119W 3243 nt3.25□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 YHR078WYHR078W 1659 nt3.24□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 BIT61YJL058C 1632 nt3.24□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 SPT4YGR063C 309 nt3.24□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 PSY1YKL076C 384 nt3.24□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 BNI4YNL233W 2679 nt3.23□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 snR80snR80 171 nt3.23□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.23□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.23□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt3.23□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 YAR070CYAR070C 300 nt3.23□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 RPL26AYLR344W 384 nt3.23□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt3.23□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 COX7YMR256C 183 nt3.23□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 STU2YLR045C 2667 nt3.23□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 MYO5YMR109W 3660 nt3.22□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 CDH1YGL003C 1701 nt3.22□□□□□ -1.89
UPC2Q12151 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.1 ms