Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFFO1Q0D2I5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms