Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms