Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CTDSPL2Q05D32 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTDSPL2Q05D32 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms