Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 CCM1YGR150C 2595 nt3.58□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 SPT16YGL207W 3108 nt3.58□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 YDL180WYDL180W 1644 nt3.57□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 GPI8YDR331W 1236 nt3.57□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.57□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.57□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.57□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.57□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.57□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.57□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.57□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 AAD16YFL057C 459 nt3.57□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 RPC10YHR143W-A 213 nt3.57□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 PAU23YLR037C 375 nt3.57□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 TOP1YOL006C 2310 nt3.57□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 TIM18YOR297C 579 nt3.57□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 snR36snR36 182 nt3.57□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 SIN3YOL004W 4611 nt3.57□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 GYL1YMR192W 2163 nt3.56□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 CCT7YJL111W 1653 nt3.56□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 NMA111YNL123W 2994 nt3.56□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.56□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 YMR320WYMR320W 306 nt3.56□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 CHS3YBR023C 3498 nt3.55□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 SEC15YGL233W 2733 nt3.55□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt3.55□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 ISU1YPL135W 498 nt3.55□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 HEF3YNL014W 3135 nt3.55□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 STE5YDR103W 2754 nt3.55□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 VHR2YER064C 1518 nt3.54□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 YEL057CYEL057C 702 nt3.54□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 YER188C-AYER188C-A 300 nt3.54□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 PEX11YOL147C 711 nt3.54□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 SNX41YDR425W 1878 nt3.54□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 RPN1YHR027C 2982 nt3.54□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 YCG1YDR325W 3108 nt3.53□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 TSA2YDR453C 591 nt3.53□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 SPG3YDR504C 384 nt3.53□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 RPB9YGL070C 369 nt3.53□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 MSL1YIR009W 336 nt3.53□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt3.53□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 GCD6YDR211W 2139 nt3.53□□□□□ -1.84
HRQ1Q05549 NDD1YOR372C 1665 nt3.52□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 RSM19YNR037C 276 nt3.52□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 RPL20BYOR312C 519 nt3.52□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 YPL238CYPL238C 390 nt3.52□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 RPS23BYPR132W 438 nt3.52□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 SNF12YNR023W 1701 nt3.52□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 FLO9YAL063C 3969 nt3.52□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 PWP2YCR057C 2772 nt3.51□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 RMT2YDR465C 1239 nt3.51□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 LSM8YJR022W 330 nt3.51□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 PRE8YML092C 753 nt3.51□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 TRZ1YKR079C 2517 nt3.51□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 PHO81YGR233C 3537 nt3.51□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 NTO1YPR031W 2247 nt3.5□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 YOR296WYOR296W 3870 nt3.5□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 STN1YDR082W 1485 nt3.5□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 YDR250CYDR250C 276 nt3.5□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 DLS1YJL065C 504 nt3.5□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 YJL202CYJL202C 348 nt3.5□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 SHE2YKL130C 741 nt3.5□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 PDC2YDR081C 2778 nt3.49□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 YER107W-AYER107W-A 321 nt3.49□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt3.49□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 MNT3YIL014W 1893 nt3.49□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 HEH2YDR458C 1992 nt3.49□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 REG1YDR028C 3045 nt3.49□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 COX23YHR116W 456 nt3.48□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 BAT1YHR208W 1182 nt3.48□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 URM1YIL008W 300 nt3.48□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 PHD1YKL043W 1101 nt3.48□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 YLR031WYLR031W 561 nt3.48□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 SSN8YNL025C 972 nt3.48□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 YNL337WYNL337W 255 nt3.48□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 YHR080CYHR080C 4038 nt3.48□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 UBP14YBR058C 2346 nt3.48□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 BIT61YJL058C 1632 nt3.48□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 RAD4YER162C 2265 nt3.47□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 ATG13YPR185W 2217 nt3.47□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 HMF1YER057C 390 nt3.47□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 BNI4YNL233W 2679 nt3.47□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 EPL1YFL024C 2499 nt3.47□□□□□ -1.85
HRQ1Q05549 BYE1YKL005C 1785 nt3.46□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.46□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 CAJ1YER048C 1176 nt3.46□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt3.46□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt3.46□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 RPL9BYNL067W 576 nt3.46□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 VBA4YDR119W 2307 nt3.45□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 PMR1YGL167C 2853 nt3.45□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 FAR1YJL157C 2493 nt3.45□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 SSY1YDR160W 2559 nt3.45□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt3.45□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt3.45□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 LSM1YJL124C 519 nt3.45□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 PGA1YNL158W 597 nt3.45□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 SYT1YPR095C 3681 nt3.45□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 MSH2YOL090W 2895 nt3.45□□□□□ -1.86
HRQ1Q05549 GCN4YEL009C 846 nt3.44□□□□□ -1.86
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