Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARID5AQ03989 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARID5AQ03989 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms