Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKX2-5P52952 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NKX2-5P52952 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms