Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRCA2P51587 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRCA2P51587 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms