Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRIP1P48552 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRIP1P48552 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms