Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YER137C-AYER137C-A 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YER159C-AYER159C-A 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YJR026WYJR026W 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YJR028WYJR028W 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YAR010CYAR010C 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YML040WYML040W 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YML045W-AYML045W-A 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YMR051CYMR051C 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 TRM2YKR056W 1920 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 KAP120YPL125W 3099 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 HUL5YGL141W 2733 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 DPP1YDR284C 870 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YDR355CYDR355C 303 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 MSA2YKR077W 1092 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 OMA1YKR087C 1038 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YNL234WYNL234W 1281 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YPL035CYPL035C 348 nt1.05□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 UBC13YDR092W 462 nt1.04□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 MGE1YOR232W 687 nt1.04□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt1.04□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 CTF18YMR078C 2226 nt1.04□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 TRM12YML005W 1389 nt1.04□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YGL242CYGL242C 546 nt1.04□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 SPC29YPL124W 762 nt1.04□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 MRP2YPR166C 348 nt1.04□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 ARI1YGL157W 1044 nt1.03□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.03□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 SMD3YLR147C 306 nt1.03□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt1.03□□□□□ -2.24
YRF1-2P40105 YDR521WYDR521W 336 nt1.02□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 PEP8YJL053W 1140 nt1.02□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 RNP1YLL046C 750 nt1.02□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 YOR218CYOR218C 420 nt1.02□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 BEM3YPL115C 3387 nt1.02□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 CDC36YDL165W 576 nt1.01□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 CMC4YMR194C-B 222 nt1.01□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 VTI1YMR197C 654 nt1.01□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt1□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt1□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt1□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt1□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt1□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt1□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt1□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt1□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt1□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt1□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt1□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 AIM36YMR157C 768 nt1□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 RIO2YNL207W 1278 nt1□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 OST2YOR103C 393 nt1□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 HMS1YOR032C 1305 nt1□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 CET1YPL228W 1650 nt1□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 AEP3YPL005W 1821 nt0.99□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 HAP4YKL109W 1665 nt0.99□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 RPL31AYDL075W 342 nt0.99□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 MED8YBR193C 672 nt0.99□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 MON1YGL124C 1935 nt0.99□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 AI1Q0050 2505 nt0.98□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 CRD1YDL142C 852 nt0.98□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 PDS5YMR076C 3834 nt0.98□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt0.98□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 VID24YBR105C 1089 nt0.98□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 SET3YKR029C 2256 nt0.98□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 BNS1YGR230W 414 nt0.97□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 MMF1YIL051C 438 nt0.97□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 ALG5YPL227C 1005 nt0.97□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 MFB1YDR219C 1398 nt0.97□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 VPS9YML097C 1356 nt0.97□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 SUI2YJR007W 915 nt0.97□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 YLR053CYLR053C 327 nt0.97□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 NOP15YNL110C 663 nt0.97□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 PRM4YPL156C 855 nt0.97□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 LDH1YBR204C 1128 nt0.97□□□□□ -2.25
YRF1-2P40105 CLG1YGL215W 1359 nt0.96□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 RRT15YLR162W-A 189 nt0.96□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt0.96□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 RGM1YMR182C 636 nt0.96□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 YDR338CYDR338C 2088 nt0.95□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 PUS9YDL036C 1389 nt0.95□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 AVT5YBL089W 1380 nt0.95□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 snR76snR76 109 nt0.95□□□□□ -2.26
YRF1-2P40105 MSS2YDL107W 1056 nt0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 91 ms