Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCD1P33897 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCD1P33897 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms