Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD40LGP29965 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD40LGP29965 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms