Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRDP23468 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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