Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
LHCGRP22888 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHCGRP22888 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHCGRP22888 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHCGRP22888 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LHCGRP22888 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LHCGRP22888 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHCGRP22888 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms