Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FGFR4P22455 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FGFR4P22455 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms