Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK11BP21127 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms