Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNA2P20248 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms