Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCLP19338 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCLP19338 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCLP19338 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCLP19338 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCLP19338 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCLP19338 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCLP19338 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCLP19338 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCLP19338 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NCLP19338 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCLP19338 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCLP19338 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCLP19338 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCLP19338 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCLP19338 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCLP19338 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCLP19338 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCLP19338 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLP19338 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLP19338 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLP19338 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLP19338 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLP19338 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLP19338 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLP19338 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLP19338 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLP19338 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLP19338 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLP19338 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLP19338 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLP19338 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLP19338 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLP19338 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLP19338 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLP19338 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLP19338 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLP19338 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCLP19338 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLP19338 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLP19338 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLP19338 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLP19338 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLP19338 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLP19338 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLP19338 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLP19338 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLP19338 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLP19338 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLP19338 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLP19338 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLP19338 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLP19338 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLP19338 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLP19338 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLP19338 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLP19338 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCLP19338 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCLP19338 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCLP19338 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCLP19338 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCLP19338 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCLP19338 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLP19338 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLP19338 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLP19338 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLP19338 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLP19338 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLP19338 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLP19338 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLP19338 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLP19338 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLP19338 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLP19338 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLP19338 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLP19338 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLP19338 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCLP19338 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms