Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF4P18085 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF4P18085 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF4P18085 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF4P18085 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF4P18085 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF4P18085 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF4P18085 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF4P18085 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF4P18085 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF4P18085 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF4P18085 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF4P18085 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF4P18085 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF4P18085 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF4P18085 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF4P18085 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF4P18085 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF4P18085 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF4P18085 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF4P18085 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF4P18085 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF4P18085 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF4P18085 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF4P18085 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF4P18085 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF4P18085 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF4P18085 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF4P18085 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF4P18085 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF4P18085 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF4P18085 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF4P18085 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF4P18085 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF4P18085 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF4P18085 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF4P18085 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF4P18085 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF4P18085 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF4P18085 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF4P18085 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF4P18085 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF4P18085 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF4P18085 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF4P18085 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF4P18085 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF4P18085 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF4P18085 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF4P18085 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF4P18085 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF4P18085 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF4P18085 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF4P18085 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF4P18085 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF4P18085 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF4P18085 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF4P18085 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF4P18085 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF4P18085 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF4P18085 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF4P18085 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF4P18085 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF4P18085 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF4P18085 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF4P18085 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF4P18085 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF4P18085 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF4P18085 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF4P18085 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF4P18085 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF4P18085 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF4P18085 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF4P18085 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF4P18085 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF4P18085 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF4P18085 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARF4P18085 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARF4P18085 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARF4P18085 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF4P18085 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF4P18085 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF4P18085 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF4P18085 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF4P18085 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF4P18085 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF4P18085 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF4P18085 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF4P18085 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF4P18085 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF4P18085 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF4P18085 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF4P18085 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF4P18085 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF4P18085 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF4P18085 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF4P18085 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF4P18085 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF4P18085 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF4P18085 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF4P18085 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms