Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA5P08648 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms