Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYCNP04198 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYCNP04198 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYCNP04198 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYCNP04198 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYCNP04198 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYCNP04198 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYCNP04198 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYCNP04198 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYCNP04198 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYCNP04198 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MYCNP04198 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYCNP04198 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYCNP04198 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYCNP04198 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYCNP04198 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYCNP04198 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCNP04198 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCNP04198 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCNP04198 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCNP04198 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCNP04198 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCNP04198 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCNP04198 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCNP04198 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCNP04198 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCNP04198 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCNP04198 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCNP04198 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCNP04198 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCNP04198 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCNP04198 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCNP04198 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCNP04198 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCNP04198 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYCNP04198 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYCNP04198 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYCNP04198 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYCNP04198 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYCNP04198 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYCNP04198 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYCNP04198 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYCNP04198 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MYCNP04198 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYCNP04198 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYCNP04198 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYCNP04198 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYCNP04198 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYCNP04198 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYCNP04198 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYCNP04198 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYCNP04198 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYCNP04198 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYCNP04198 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYCNP04198 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYCNP04198 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYCNP04198 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYCNP04198 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MYCNP04198 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYCNP04198 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYCNP04198 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYCNP04198 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYCNP04198 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYCNP04198 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYCNP04198 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYCNP04198 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MYCNP04198 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYCNP04198 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYCNP04198 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYCNP04198 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MYCNP04198 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MYCNP04198 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MYCNP04198 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCNP04198 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCNP04198 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCNP04198 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCNP04198 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCNP04198 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCNP04198 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCNP04198 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCNP04198 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCNP04198 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCNP04198 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCNP04198 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCNP04198 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCNP04198 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCNP04198 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCNP04198 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYCNP04198 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYCNP04198 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYCNP04198 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYCNP04198 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYCNP04198 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYCNP04198 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MYCNP04198 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MYCNP04198 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYCNP04198 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYCNP04198 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYCNP04198 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYCNP04198 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms