Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DCTN3O75935 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN3O75935 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN3O75935 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN3O75935 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN3O75935 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN3O75935 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN3O75935 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN3O75935 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN3O75935 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DCTN3O75935 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN3O75935 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN3O75935 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN3O75935 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN3O75935 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN3O75935 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN3O75935 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN3O75935 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN3O75935 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN3O75935 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN3O75935 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DCTN3O75935 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms