Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRC1O43663 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRC1O43663 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRC1O43663 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRC1O43663 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRC1O43663 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRC1O43663 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRC1O43663 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRC1O43663 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRC1O43663 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRC1O43663 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRC1O43663 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRC1O43663 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRC1O43663 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRC1O43663 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRC1O43663 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRC1O43663 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRC1O43663 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRC1O43663 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRC1O43663 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRC1O43663 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRC1O43663 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRC1O43663 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRC1O43663 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRC1O43663 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRC1O43663 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRC1O43663 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRC1O43663 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRC1O43663 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRC1O43663 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRC1O43663 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRC1O43663 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRC1O43663 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRC1O43663 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRC1O43663 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRC1O43663 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRC1O43663 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRC1O43663 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRC1O43663 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRC1O43663 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRC1O43663 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRC1O43663 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRC1O43663 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRC1O43663 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRC1O43663 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRC1O43663 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRC1O43663 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRC1O43663 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRC1O43663 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRC1O43663 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRC1O43663 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRC1O43663 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRC1O43663 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRC1O43663 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRC1O43663 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRC1O43663 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRC1O43663 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRC1O43663 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRC1O43663 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRC1O43663 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRC1O43663 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRC1O43663 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRC1O43663 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRC1O43663 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRC1O43663 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRC1O43663 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRC1O43663 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRC1O43663 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRC1O43663 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRC1O43663 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRC1O43663 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRC1O43663 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRC1O43663 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRC1O43663 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRC1O43663 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRC1O43663 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRC1O43663 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRC1O43663 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRC1O43663 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRC1O43663 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRC1O43663 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRC1O43663 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRC1O43663 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRC1O43663 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRC1O43663 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRC1O43663 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRC1O43663 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRC1O43663 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRC1O43663 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRC1O43663 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRC1O43663 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRC1O43663 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRC1O43663 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRC1O43663 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRC1O43663 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRC1O43663 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRC1O43663 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRC1O43663 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRC1O43663 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRC1O43663 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms