Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APAF1O14727 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APAF1O14727 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APAF1O14727 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APAF1O14727 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APAF1O14727 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APAF1O14727 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APAF1O14727 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APAF1O14727 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APAF1O14727 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APAF1O14727 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APAF1O14727 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
APAF1O14727 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APAF1O14727 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APAF1O14727 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APAF1O14727 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
APAF1O14727 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APAF1O14727 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APAF1O14727 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APAF1O14727 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APAF1O14727 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
APAF1O14727 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APAF1O14727 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APAF1O14727 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APAF1O14727 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APAF1O14727 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APAF1O14727 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APAF1O14727 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APAF1O14727 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APAF1O14727 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APAF1O14727 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APAF1O14727 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APAF1O14727 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
APAF1O14727 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APAF1O14727 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APAF1O14727 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APAF1O14727 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
APAF1O14727 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APAF1O14727 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APAF1O14727 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APAF1O14727 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APAF1O14727 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APAF1O14727 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
APAF1O14727 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
APAF1O14727 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APAF1O14727 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APAF1O14727 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APAF1O14727 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APAF1O14727 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APAF1O14727 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APAF1O14727 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APAF1O14727 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APAF1O14727 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APAF1O14727 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APAF1O14727 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APAF1O14727 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APAF1O14727 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
APAF1O14727 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
APAF1O14727 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
APAF1O14727 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APAF1O14727 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APAF1O14727 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APAF1O14727 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APAF1O14727 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APAF1O14727 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APAF1O14727 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APAF1O14727 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APAF1O14727 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APAF1O14727 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APAF1O14727 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APAF1O14727 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APAF1O14727 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APAF1O14727 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APAF1O14727 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APAF1O14727 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APAF1O14727 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APAF1O14727 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APAF1O14727 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APAF1O14727 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APAF1O14727 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APAF1O14727 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APAF1O14727 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APAF1O14727 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APAF1O14727 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APAF1O14727 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APAF1O14727 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
APAF1O14727 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APAF1O14727 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APAF1O14727 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
APAF1O14727 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APAF1O14727 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APAF1O14727 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APAF1O14727 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APAF1O14727 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APAF1O14727 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APAF1O14727 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APAF1O14727 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
APAF1O14727 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APAF1O14727 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APAF1O14727 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms