Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SUPT5HO00267 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SUPT5HO00267 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms