Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A0D9SFI3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0D9SFI3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms