Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HDGFL3Q9Y3E1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms