Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSX2IPQ9Y2D8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SSX2IPQ9Y2D8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms