Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAPN11Q9UMQ6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN11Q9UMQ6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms