Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIX4Q9UIU6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SIX4Q9UIU6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms