Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNNA3Q9UI47 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNNA3Q9UI47 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms