Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
MLH3Q9UHC1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms