Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms