Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPASTQ9UBP0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPASTQ9UBP0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms