Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
RRBP1Q9P2E9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RRBP1Q9P2E9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms