Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFNKQ9P0W0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNKQ9P0W0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms