Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVS9

PNPO, Pyridoxine-5'-phosphate oxidase, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPOQ9NVS9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNPOQ9NVS9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNPOQ9NVS9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms